Ein wesentlicher Teil von Stefano Mhannas musikalischer Tätigkeit findet in Kirchen statt: Hier präsentiert er Programme für Solo-Orgel und Solo-Violine, manchmal spielt er sogar in ein- und demselben Konzert beide Instrumente.
Sein Lieblingskomponist für diese musikalischen Veranstaltungen ist Johann Sebastian Bach.
Seit 2023 führt er jeden zweiten Sonntag im Monat von Oktober bis Juni in der Kirche des Heiligen Namens Jesu in Rom vor einem großen und begeisterten Publikum ein Programm auf, das hauptsächlich der Musik von J. S. Bach gewidmet ist. Bei diesen Veranstaltungen hat er alle Sonaten und Partiten für Violine solo sowie die meisten Fantasien, Toccaten, Präludien und Fugen aufgeführt.
Im Jahr 2025 spielte er Musik von Bach und anderen Komponisten auf Orgel und Violine für folgende Musikinstitutionen:
- Graz: Abendkonzerte in der Mariahilfkirche, 20. Juli 2025
- Krems: KirchenTonArt-Orgelsommer in St. Veit – Dom der Wachau, 17. Juli 2025
- Rom: IUC-Konzerte | 80 Jahre klassische Musik in Rom (Universitätskonzertinstitut der Universität Rom „La Sapienza“), Konzertreihe „Organizzando“, 23. Mai 2025
Im selben Jahr gab er eine Reihe von Orgelkonzerten für die Stadt Rom und spielte Werke von Bach und anderen Komponisten (Widor, Franck, Frescobaldi, Pera und anderen) auf historischen Orgeln in verschiedenen Kirchen und Basiliken Roms.
Außerdem gab er am 24. Februar 2025 das Einweihungskonzert für die restaurierte Orgel in der Kathedrale von Nardò für die Diözese Nardò-Gallipoli.
Am 15. April 2025 wurde er vom Journalisten und Musikwissenschaftler Marco Di Battista und dem Journalisten, Komponisten und Pianisten Marcello Filotei eingeladen, im Radio Vatikan (Vatican News) über seine Konzerttätigkeit zu sprechen, wobei er sich auf seinen Aufführungsstil der Musik von Johann Sebastian Bach konzentrierte.


Im Jahr 2024
- Altivole (Treviso): XXXVI. Internationales Orgelfestival „Stadt Treviso und der Treviso-Marsch“, 27. September 2024
- Lecce: 10. Ausgabe des Salento-Orgelfestivals, 31. August 2024
- Lausanne: „Concert aux chandelles – Jeux de feu“, 8. März 2024
Im Jahr 2023:
- Genf: „Saint-Pierre en lumières“ der Fondation des Clefs de Saint-Pierre, (Spenderabend der Genfer Evangelischen Kirche), 24. November 2023



Er spielte Musik von J. S. Bach und war Soloorganist bei den Eröffnungskonzerten zahlreicher Kirchen, darunter der Kirche des Instituts „Artigianelli“ in Brescia, der Basilika des Heiligtums S. Rita da Cascia, der Kirche S. Giuseppe Artigiano in Foligno, der Basilika des Heiligtums Santa Maria del Colle in Lenola, der Basilika des Heiligen Herzens in Rom, der Basilika S. Maria Ausiliatrice in Rom und der Kirche S. Giuseppe in Santa Marinella.
Er tritt als Solist bei wichtigen Festivals auf (oft abwechselnd als Orgel- und Violinsolist), das Festival „Soli Deo Gloria – Orgeln, Klänge und Stimmen der Stadt“ des Vereins Cappella Musicale San Francesco da Paola und der Gemeinde von Reggio nell’Emilia, die „XXI. Konzertsaison“ und die „XXII. Konzertsaison“ der Chor und Knabenchor der Kathedrale von Modena, „Il Suono dell’Organo“, 25. Ausgabe der Basilika Don Bosco/Salesianisches Kulturzentrum, das Reate Festival, 10. Ausgabe der Flavio Vespasiano-Stiftung, der „34. Franziskanische Organistische Oktober“ des Musikvereins „Fabio da Bologna“, die Konzerte der Varrone-Stiftung – ehemalige Cassa di Risparmio di Rieti und der „Gesellschaft zur Erhaltung der Basilika von Aquileia“-Stiftung .
Am 5. Dezember 2012 gab er in der Kapelle des Governatorats des Staates Vatikanstadt ein Solokonzert mit Violine und Orgel, das ganz der Musik von J. S. Bach gewidmet war. Anwesend waren Kardinäle, Bischöfe, der Chorleiter der Giulia-Kapelle, Msgr. Pablo Colino, und Staatsangestellte. Das Konzert wurde live von Radio Vatikan aufgezeichnet und in der internen Mitarbeiterzeitung „All’ombra del Cupolone“ besprochen. Stefano Mhanna erhielt vom Kardinalpräsidenten des Governatorats, Kardinal Giovanni Lajolo, eine numismatische Sammlung des Vatikans als Geschenk.


